Une diversité encore méconnue au sein des biofilms à Cyanobactéries benthiques dans les rivières - Université Pierre et Marie Curie Accéder directement au contenu
Poster De Conférence Année : 2013

Une diversité encore méconnue au sein des biofilms à Cyanobactéries benthiques dans les rivières

Résumé

Les cyanobactéries benthiques se développent sous forme de biofilms au fond de certaines rivières peu profondes. Dans des conditions environnementales encore mal connues, elles peuvent proliférer et poser des problèmes sanitaires car certaines espèces produisent des neurotoxines. Au sein des biofilms, les cyanobactéries cohabitent avec d’autres producteurs primaires (diatomées et chlorophycées principalement) mais aussi avec d’autres bactéries. Notre principal objectif est d’évaluer la composition et la diversité de ces biofilms à cyanobactéries et de rechercher s’il existe des associations privilégiées au sein des biofilms, entre les cyanobactéries et les autres microorganismes présents. Par une approche moléculaire (pyroséquençage 454 sur un fragment d’ARNr 16S), il est apparu que la composante bactérienne de ces biofilms présente une très grande diversité, même si les protéobactéries (56%) et en particulier les alphaprotéobactéries (43%) dominent toujours ces communautés. Parmi ces dernières, les OTU les plus abondantes appartiennent au genre Rhodobacter (8%), qui est connu pour posséder des capacités métaboliques très diverses, dont celle de réaliser la photosynthèse. Ce résultat suggère que ces bactéries contribuent significativement à la production primaire dans cette rivière, en complément des cyanobactéries et des microalgues. Enfin, des variations spatiotemporelles ont été observées dans la composition de ces biofilms en liaison avec leur origine géographique et les dates de prélèvement. Une approche similaire à celle réalisée sur les communautés bactériennes est en cours d’analyse sur la communauté de microeucaryotes (pyroséquençage d’un fragment d’ARNr 18S). Elle devrait nous permettre de mieux connaître cette communauté et d’identifier des associations entre bactéries et eucaryotes.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-04080839 , version 1 (25-04-2023)

Identifiants

  • HAL Id : hal-04080839 , version 1

Citer

Anouk Zancarini, Isidora Echenique-Subiabre, Didier Debroas, Catherine Quiblier, Jean-François Humbert. Une diversité encore méconnue au sein des biofilms à Cyanobactéries benthiques dans les rivières. Réseau National des Biofilms, Nov 2013, Pau, France. ⟨hal-04080839⟩
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